Відділ заснований у 1987 році. На сьогоднішній день новітні інформаційні технології та розробки відділу визначають принципи розвитку всієї хірургічної галузі нашої країни. Це центр координації розвитку та покращення всієї української хірургії.

Основні напрямки науково-практичної діяльності відділу:

• аналіз стану надання хірургічної допомоги та медичних послуг (або їх конкретних видів) населенню України та окремих регіонів
• визначення загальних тенденцій (динаміки), причин, що впливають на якість хірургічної допомоги та медичних послуг
• розробка заходів з удосконалення організації хірургічної допомоги населенню України
• вивчення досягнень хірургічної науки за кордоном з метою прогнозування перспективних наукових досліджень в Україні та інформування наукових співробітників про нові зарубіжні технології
• експертиза нововведень, що пропонуються до впровадження в практику лікувальних установ України, науково-дослідних робіт з проблеми "Хірургія", які виконуються в науково-дослідних та навчальних медичних закладах України, документів на планування докторських та кандидатських дисертацій з проблеми "Хірургія"
• планування, організація та проведення наукових, науково-практичних та практичних заходів (з'їздів, конференцій, семінарів, симпозіумів, шкіл та робочих нарад) з проблем хірургії
• організація освоєння практичними спеціалістами новітніх технологій на базі клініки Інституту (курси) на основі угод.
• організація та підтримка центрального Інтернет сайту інституту, забезпечення його постійного функціонування, оновлення та поповнення новою інформацією
• налагодження та підтримка міжнародних зв’язків з провідними світовими хірургічними та науковими клініками та Асоціаціями
• інформування населення щодо діяльності інституту та стану хірургічної галузі країни шляхом організації виступів в ЗМІ, організації онлайн-трансляцій,  прес-конференцій, тощо.